Бухгалтерский учёт за ОП ведёт головная компания. К рабочему плану счетов добавляют субсчета, чтобы в аналитическом учёте разделить потоки головной фирмы и обособленного подразделения.
Порядок распределения расходов выбирают по собственному усмотрению, но обычно руководствуются долями в общей выручке. Первичные документы выставляют от имени ГК.
Если компания применяет УСН, то она уплачивает единый налог, даже если ОП находится в другом городе или регионе. С декларацией по налогу на прибыль сложнее, потому что нужно готовить два варианта:
Общую — отражают совокупные показатели по ГК и ОП.
Сокращённую на каждое обособленное подразделение — титульный лист, подразделы 1.1, 1.2 и приложение № 5 ко второму листу.
Общую сдают по месту регистрации головной организации, а сокращённую — в ИФНС, к которой относится ОП.
Страховые взносы и НДФЛ платит головная фирма, даже если у подразделения отдельный расчётный счёт и оно самостоятельно рассчитывается по зарплатам. С 2023 г. действует ЕНП, каждой фирме открыли единый налоговый счёт с привязкой к ИНН. У ОП нет налогового идентификатора, поэтому оно не может выполнять обязательства и индивидуально пополнять ЕНС.